Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU., CDC, lanzaron un consorcio para poner en marcha una red nacional de laboratorios de secuenciación que acelerará la publicación de los datos de la secuencia del SARS-CoV-2 en el dominio público. La publicación rápida de los datos abiertos de la secuencia del coronavirus ayudará a guiar COVID-19 respuesta de salud pública, impulsar la innovación y el descubrimiento, y avanzar en la comprensión de esta y futuras pandemias.
Este Secuenciación del SARS-CoV-2 para la respuesta de emergencia de salud pública, epidemiología y vigilancia (ESFERAS) consorcio, que ampliará enormemente el uso de secuenciación del genoma completo (WGS) del virus COVID-19. SPHERES proporcionará datos de secuencia coherentes y en tiempo real a los equipos de respuesta de salud pública que investigan casos y grupos de COVID-19 en todo el país.
Este nuevo consorcio les ayudará a comprender mejor cómo se está propagando el virus, tanto a nivel nacional como en sus comunidades locales. A su vez, mejores datos ayudarán a los funcionarios de salud pública a interrumpir las cadenas de transmisión, prevenir nuevos casos de enfermedad y proteger y salvar vidas.
“Estados Unidos es el líder mundial en secuenciación avanzada del genoma rápido. Este esfuerzo coordinado en nuestros laboratorios de salud pública públicos, privados, clínicos y académicos desempeñará un papel vital en la comprensión de la transmisión, evolución y tratamiento del SARS-CoV-2. Estoy seguro de que nuestras mentes más finas y capacitadas están trabajando juntas para ayudarnos a salvar vidas hoy y mañana ”, dijo el director de los CDC, Robert Redfield, MD.
Seguimiento del virus COVID-19 a medida que evoluciona
Los datos de la secuencia genómica pueden brindar una visión sin precedentes de la biología del SARS-CoV-2, el virus que causa el COVID-19, y ayudar a definir el panorama cambiante de la pandemia. Al secuenciar virus de todo Estados Unidos, los CDC y otras autoridades de salud pública pueden monitorear cambios importantes en el virus y usar esta información para guiar el rastreo de contactos, los esfuerzos de mitigación de salud pública y las estrategias de control de infecciones.
El consorcio SPHERES es un esfuerzo ambicioso para coordinar la secuenciación del genoma del SARS-CoV-2 a nivel nacional, organizando docenas de esfuerzos individuales más pequeños en una sola red distribuida de laboratorios, instituciones y corporaciones. El consorcio combina la experiencia, la tecnología y los recursos de 40 departamentos de salud pública estatales y locales, varios laboratorios clínicos grandes y más de dos docenas de instituciones colaboradoras en el gobierno federal, el mundo académico y el sector privado.
SPHERES establecerá las mejores prácticas y estándares de datos consensuados, acelerará el intercambio de datos abiertos y establecerá un conjunto de recursos y experiencia para ayudar a llevar tecnología de punta a la respuesta nacional COVID-19.
SPHERES datos abiertos, compartidos
Los miembros del consorcio comparten el compromiso de compartir rápidamente secuencias abiertas. Planean enviar todos los datos de secuencia útiles a repositorios públicos en el Centro Nacional de Información Biotecnológica de la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM / NCBI), la Iniciativa Global para Compartir Datos de Influenza Aviar (GISAID) y otros repositorios públicos de secuencias. Esto ayudará a garantizar que los datos de secuencias virales de todo Estados Unidos estén disponibles rápidamente para la toma de decisiones de salud pública y sean de libre acceso para los investigadores de todo el mundo.
Los miembros del consorcio incluyen:
Agencias y laboratorios federales
Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades, Oficina de Detecciones Moleculares Avanzadas
Argonne National Laboratory
Agencia de Defensa de la Salud, Infeccioso global Enfermedades Vigilancia
Food and Drug Administration
Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley
Laboratorio Nacional de Los Alamos
Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas, Oficina de Genómica y Tecnología Avanzada
Instituto Nacional de Estándares y Tecnología
Centro Nacional de Información Biotecnológica de la Biblioteca Nacional de Medicina
Walter Reed Army Institute of Research
Laboratorios de salud pública estatales / locales
Arizona
California.
Delaware
Distrito de Columbia
Florida
Hawái
Maine
Maryland
Massachusetts
Michigan
Minnesota
North Carolina
North Dakota
Nevada
New Mexico
New York
Utah
Virginia
Washington
Wisconsin
Wyoming
Instituciones académicas
Universidad Baylor
Cornell University
Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson
Escuela de Medicina Mount Sinai
New York University
Northern Arizona University
Universidad de Buffalo
Universidad de California, Berkeley
Universidad de California, Davis
Universidad de California, Irvine
Universidad de California en Los Ángeles
Universidad de California, San Francisco
Universidad de California, Santa Cruz
Universidad de Chicago
Universidad de Maryland
Universidad de Minnesota
Universidad de Nebraska
Universidad de Nuevo México
Universidad de Washington
Universidad de Yale
Corporaciones
Diagnóstico de Abbott
bioMerieux
Genómica del color
Bioworks de Gingko
ID por ADN
En-Q-Tel
LabCorp
Un Codex
Tecnologías Oxford Nanopore
Biociencias del Pacífico
Qiagen
quest Diagnostics
Verily Life Sciences
Los nombres de las corporaciones se proporcionan solo con fines informativos, y su inclusión aquí no constituye un respaldo de las corporaciones o cualquiera de sus productos o servicios comerciales por parte de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU.
Institutos de investigación o salud pública sin fines de lucro
Asociación de Laboratorios de Salud Pública
Bill y Melinda Gates
Instituto amplio
BioHub de Chan Zuckerberg
Instituto Craig Venter
Alianza de salud pública para la epidemiología genómica
Investigación de Scripps
El laboratorio de Jackson
Instituto de Investigación de Genómica Traslacional - Norte
Fundación Walder
Durante los últimos seis años, el programa de la Oficina de Detección Molecular Avanzada de los CDC ha invertido en laboratorios de salud pública federales y estatales para expandir el uso de la genómica de patógenos y otras tecnologías de laboratorio avanzadas para la vigilancia de enfermedades infecciosas y la respuesta a brotes. La inversión actual del consorcio tiene como objetivo salvar vidas en la pandemia SARS-CoV-2 y preparar a los Estados Unidos y al mundo para una futura respuesta a una pandemia.
Para obtener más información sobre la secuenciación genómica o el trabajo de los CDC en detección molecular avanzada, visite https://www.cdc.gov/amd/
